Institut de recherche
Interactions
génome / populations / environnement
chez les poissons tropicaux
Présentation
Prenant pour objet d'étude différentes espèces de poissons d'intérêt économique, l'UR081 a pour objectif général de répondre aux questions suivantes :
- Quels sont les rôles des facteurs écologiques, génétiques et historiques dans la structuration des populations ?
- Quels sont les rôles de la plasticité phénotypique et des traits d'histoire de vie dans l'adaptation et le maintien des populations ?
Les travaux de cette UR sont développés sur quatre implantations dans le monde. En matière d'application, ils contribuent à l'acquisition de bases biologiques essentielles à la diversification et à l'amélioration des productions aquacoles ainsi qu'à la gestion viable des pêcheries. Ils concourent aussi à guider les efforts de conservation et les politiques d'aménagement.
Sur son implantation de Nouvelle-Calédonie, le programme de l'UR 081 porte sur l'écologie et la génétique des populations de poissons pélagiques de petite taille de l'Indo-Pacifique et concerne principalement les espèces des genres Encrasicholina et Stolephorus. Ces anchois sont parmi les espèces les plus représentées en termes de nombre d'espèces et d'abondance dans l'habitat pélagique côtier de l'Indo-Pacifique. Elles sont recherchées pour la consommation humaine dans les pays du Sud-Est asiatique et comme appâts vivants par les thoniers canneurs dans tout l'Ouest-Pacifique. Ces espèces, dont les abondances peuvent fluctuer de façon importante au cours du temps, présentent des caractéristiques biologiques contrastées : durée du cycle vital, longueur maximale atteinte, taille à la première maturité et fréquence de reproduction.
Les objectifs principaux de l'UR081 au centre IRD de Nouméa sont :
- de déterminer les facteurs de l'environnement qui permettent le maintien dans un même lagon d'espèces d'anchois qui présentent des caractéristiques biologiques différentes
- de vérifier si les modalités de reproduction et de vie larvaire constituent des adaptations locales des populations ou bien correspondent à des modalités développées par des espèces ancestrales
- d'étudier les liens qui peuvent exister entre le mode de reproduction de ces différentes espèces et la structure génétique de leurs populations
Premières actions de recherche prévues :
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Une
des premières actions de recherche sera de clarifier
la systématique des anchois calédoniens grâce à des
techniques traditionnelles (morphométrie
des corps et des otolithes
des adultes ainsi que position des nageoires, nombre de
rayons des nageoires, etc.) validées par les outils de
biologie moléculaire.
La reconnaissance des premiers stades de vie étant encore plus délicate que celle des adultes, un effort particulier sera porté sur l'identification des larves et des juvéniles de ces espèces. |
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Lorsque
les outils d'identification auront été mis au point,
les régimes alimentaires des premiers stades de vie
des différentes
espèces seront précisés ainsi que les traits biologiques
relatifs à la reproduction pour chaque espèce (période
de reproduction, fécondité,
tailles des œufs).
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Modification
de la tête des anchois du genre Encrasicholina au
cours de leur développement. Taille des individus
a) 29mm, b) 38mm, c) 7mm et d) 55 mm (adulte). |
Exemples d'activités scientifiques
Depuis août 2001, des campagnes mensuelles d'essais d'échantillonnage des stades adultes et juvéniles des anchois sont effectuées dans plusieurs baies du lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie à l'aide de pièges lumineux. Les données obtenues permettront de mettre au point une stratégie d'échantillonnage adaptée aux questions posées.
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Dispositif
utilisé pour capturer les anchois (1 : piège lumineux, 2 : bouée de
repérage, 3 : bouée de rappel, 4 : lest). |
Préparation d'un piège lumineux avant sa mise à l'eau. |
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Tous
les échantillons sont conservés dans de l'éthanol 95% afin de permettre
une parfaite conservation des tissus pour les analyses. Les jeunes
poissons conservés dans l'alcool pouvant subir des modifications
de leur morphologie, des images digitales calibrées de tous les
stades jeunes capturés sont effectuées dans la semaine qui suit
la campagne d'échantillonnage
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Images
calibrées de jeunes anchois, les barres blanches correspondent à 5mm |
En
Métropole, à la Station de Biologie de l’Université
Montpellier II à Sète, sont mis au point des marqueurs génétiques
permettant d’identifier les espèces et les populations d’anchois
des genres Encrasicholina, et Stolephorus.
Au centre IRD de Nouméa, à partir de 2002, des analyses
génétiques seront effectuées au laboratoire de biologie
moléculaire.
Plasticité phénotypique : capacité des individus d'une même espèce à présenter des adaptations de leurs caractéristiquesmorphologiques, physiologiques, etc. en fonction de différentes conditions environnementales
Morphométrie : étude quantitative de la géométrie des formes
Otolithes : concrétion calcaire de l'oreille interne qui assure l'équilibre.
Larve : très jeune poisson qui possède des adaptations à la vie dans la colonne d'eau et dont la morphologie est souvent très différente de celle de l'adulte.
Juvénile : jeune poisson qui possède toutes les caractéristiques de l'adulte mais qui n'est pas encore mature.
Fécondité : nombre d'œufs produits par une femelle
· CSIRO,
Cleveland, Australie : écologie des populations de petits pélagiques
côtiers à Cleveland. Une seconde réunion avec nos
partenaires du CSIRO a eu lieu à Nouméa en septembre 2002
grâce au financement de l'Ambassade de France à Canberra.
· Department of Biology, University of the South Pacific, Suva,
Fidji : réunions de travail à Suva, financée pour
moitié par l'Ambassade de France à Suva, afin de présenter
notre projet. Les financements obtenus auprès de l'Ambassade de
France à Suva et du " Fonds Pacifique " devraient permettre
à un(e) étudiant(e) de l'University of South Pacific de
venir se former en 2003 aux techniques utilisées dans notre laboratoire.
· URM 16 IFREMER / Laboratoire Génome Populations Interactions
(UMR 5000 du CNRS), Station Méditerranéenne de l'Environnement
Littoral à Sète : marquage moléculaire des anchois
(genres Engraulis et Encrasicholina).
L'UR081 en Nouvelle-Calédonie accueillera dès 2002 des étudiants de l'Université Paris 6 (DEA d'Océanographie Biologique, option "Dynamique des Populations) et de l'Université Aix-Marseille (DEA Bioscience de l'Environnement, option Environnement Marin).
Au niveau régional, des réunions prévues en 2002 devraient formaliser les actions de formation prévues auprès d'étudiants de l'University of Queensland (Brisbane, Australie) et de l'University of the South Pacific (Suva, Fidji).
Deux étudiants
de DEA et une étudiante de Maîtrise ont effectué un
stage de recherche dans notre équipe en 2002.
· Janvier 2002 - septembre 2002 : Yanis BOUCHENAK-KHELLADI, Université
Aix-Marseille II. Recherches pour l'obtention d'un DEA et soutenance d'un
mémoire sur la structure génétique des populations
lagunaires et océaniques de l'anchois Engraulis encrasicolus.
· Janvier 2002 - juin 2002 : Thierry HOAREAU, Université
Paris 6. Recherches pour l'obtention d'un DEA et soutenance d'un mémoire
sur les traits reproductifs de deux espèces d'anchois du lagon
de Nouvelle-Calédonie.
· Juillet 2002 - août. 2002 : Delphine FRANKO, Université
Aix-Marseille. Stage d'été à l'UR 081 : forme des
otolithes de Encrasicholina devisi et E. heteroloba.
CONAND F. 1988. - Biologie et écologie des poissons pélagiques du lagon de Nouvelle-Calédonie utilisables comme appât thonier. ORSTOM, Paris, 239 p.
LEIS J. M., CARSON-EWART B. M. 2001. The larvae of Indo-Pacific coastal fishes. An identification guide to marine fish larvae, Leiden : Brill, 850 p.
SARPÉDONTI V., PONTON D., CHONG V.-C. 2000. - Description and ontogeny of young Stolephorus baganensis and Thryssa kammalensis, two Engraulididae from Peninsular Malaysia. J Fish Biol., 56: 1460-1476
Dominique PONTON : Dominique.Ponton@noumea.ird.nc
Philippe BORSA : Borsa@crit.univ-montp2.fr
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