Laboratoire des
Symbioses Tropicales & Méditerranéennes (LSTM),
implantation secondaire
Centre IRD Nouméa
Equipe : « Adaptation des Plantes et des Microorganismes au Nickel »
L’UMR 113 Laboratoire des Symbioses Tropicales & Méditerranéennes (IRD, CIRAD, INRA, SupAgro, Université Montpellier2 ; 42 agents permanents, dont 26 chercheurs et enseignants-chercheurs (15HDR) ; Directeur : Michel Lebrun) est une Unité de microbiologie et de biologie des plantes, spécialisée dans la biodiversité et les mécanismes de fonctionnement des microorganismes symbiotiques, et dans la réponse et l’adaptation des plantes à ces microorganismes et aux conditions extrêmes de l’environnement.
Les études et le champ d’application de L’UMR sont principalement tournés vers les milieux méditerranéens et tropicaux où les symbioses microorganismes/plantes permettent d’améliorer durablement les productions agricoles et forestières et de restaurer les environnements menacés, particulièrement
dans les Pays du Sud.
Suite à l’évaluation conduite en 2006, l’UMR 113 poursuit durant la période du contrat quadriennal actuel 2007-2010 le développement de son projet scientifique en favorisant les orientations fondamentales et finalisées
suivantes :
- caractériser la biodiversité des symbioses dans les écosystèmes méditerranéens
et tropicaux.
- comprendre la structuration
et l’évolution de la diversité génétique des populations bactériennes
symbiotiques.
- développer l’outil génomique autour des Bradyrhizobium photosynthétiques.
- caractériser une nouvelle voie symbiotique, révélée par l’absence de gènes de nodulation communs chez les Bradyhizobium photosynthétiques
- décrypter les voies de signalisation des plantes en réponse aux bactéries.
- étudier les mécanismes de l’adaptation des plantes et microorganismes associés aux contraintes édaphiques extrêmes des sols ultramafiques de Nouvelle-Calédonie.
Ces recherches
sont conduites dans cinq équipes :
- Equipe 1: Ecologie
et Physiologie Moléculaire des Bradyrhizobium Photosynthétiques (Bradyrhizobium
Photosynthétiques (BrP). Responsable: Eric Giraud, IRD
- Equipe 2: Biodiversité et
Evolution des Symbioses (BES). Responsable: Lionel Moulin, IRD
- Equipe 3: Réponse
des Plantes aux Microorganismes (Réponse des plantes (RPM). Responsable: Bruno Touraine, Professeur Université Montpellier
2
- Equipe 4: Adaptation des Plantes et des Microorganismes au Nickel (Adaptation
et Ultramafisme (A&U). Responsable: Michel Lebrun, IRD/UM2. Implantation secondaire de l’UMR 113 – Centre IRD Nouméa.
Depuis Avril 2006.
Les niveaux
d’approches de génomique fonctionnelle seront privilégiés dans cette équipe afin de caractériser les mécanismes: (i) de
l’adaptation des micro-organismes associés aux plantes : ectomycorhizes et bactéries aux conditions extrêmes (teneurs en métaux, carences en éléments minéraux) des sols ultramafiques de Nouvelle-Calédonie, (ii) des interactions plantes-microorganismes, (iii) de
la résistance et de l’hyperaccumulation des métaux chez les plantes endémiques,. L’objectif finalisé est de connaître, gérer et valoriser le fonctionnement des écosystèmes plantes et microorganismes pour la réhabilitation des sols miniers dégradés de Nouvelle-Calédonie. L’équipe coordonne et est impliquée dans plusieurs projets en relation avec ses orientations thématiques :
ANR, MOM, PPF.
En Nouvelle-Calédonie, l’équipe a assuré la mise en place et le support au développement de la Plate-Forme du Vivant de Nouvelle-Calédonie, multi-organismes (IRD, IAC, IPNC, Ifremer, UNC) implanté dans le centre IRD et opérationnelle depuis octobre 2008. L’objectif de la Plate-Forme du Vivant de Nouvelle-Calédonie est de fédérer et structurer en Nouvelle-Calédonie un pôle d’excellence scientifique en biologie moléculaire pour l’analyse de la dynamique et de la distribution spatiale des gènes et de leur expression dans les écosystèmes régionaux, du gène à l’écosystème.
Clarisse Majorel, IE IRD, est en charge du fonctionnement de la plate-forme.
Composition et implantations de l’équipe au 30 juin
2009: a- centre IRD-Nouméa : Sylvain Merlot (CR1 CNRS, accueil IRD), Marc Ducousso (Chercheur CIRAD/IAC), Philippe Jourand (IR IRD), Clarisse Majorel (IE IRD), Laure Hannibal (AI IRD) ; b- Montpellier : Michel Lebrun (PR UM2, accueil IRD) ; c- Ecole Centrale Lyon :
Isabelle Navarro (CR1 IRD).
- Equipe 5: Ecologie et Physiologie des Symbioses (EPS). Responsable: Antoine Galiana, CIRAD
Pour plus
d’informations, site de l’UMR 113 : http://www.mpl.ird.fr/lstm/
