Interactions génome / population / environnement chez les poissons tropicaux

Prenant pour objet d'étude différentes espèces de poissons d'intérêt économique, l'UR081 a pour objectif général de répondre aux questions suivantes :

Les travaux de cette UR sont développés sur quatre implantations dans le monde. En matière d'application, ils contribuent à l'acquisition de bases biologiques essentielles à la diversification et à l'amélioration des productions aquacoles ainsi qu'à la gestion viable des pêcheries. Ils concourent aussi à guider les efforts de conservation et les politiques d'aménagement.

Sur son implantation de Nouvelle-Calédonie, le programme de l'UR 081 porte sur l'écologie et la génétique des populations de poissons pélagiques de petite taille de l'Indo-Pacifique et concerne principalement les espèces des genres Encrasicholina et Stolephorus. Ces anchois sont parmi les espèces les plus représentées en termes de nombre d'espèces et d'abondance dans l'habitat pélagique côtier de l'Indo-Pacifique. Elles sont recherchées pour la consommation humaine dans les pays du Sud-Est asiatique et comme appâts vivants par les thoniers canneurs dans tout l'Ouest-Pacifique. Ces espèces, dont les abondances peuvent fluctuer de façon importante au cours du temps, présentent des caractéristiques biologiques contrastées : durée du cycle vital, longueur maximale atteinte, taille à la première maturité et fréquence de reproduction.

Les objectifs principaux de l'UR081 au centre IRD de Nouméa sont :

 

Exemples d'activités scientifiques

Depuis août 2001, des campagnes mensuelles d'essais d'échantillonnage des stades adultes et juvéniles des anchois sont effectuées dans plusieurs baies du lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie à l'aide de pièges lumineux. Les données obtenues permettront de mettre au point une stratégie d'échantillonnage adaptée aux questions posées.

 

	Dispositif utilisé pour capturer les anchois (1 : piège lumineux, 2 : bouée de repérage, 3 : bouée de rappel, 4 : lest).		Préparation d'un piège lumineux avant sa mise à l'eau.

	Tous les échantillons sont conservés dans de l'éthanol 95% afin de permettre une parfaite conservation des tissus pour les analyses. Les jeunes poissons conservés dans l'alcool pouvant subir des modifications de leur morphologie, des images digitales calibrées de tous les stades jeunes capturés sont effectuées dans la semaine qui suit la campagne d'échantillonnage
			Images calibrées de jeunes anchois, les barres blanches correspondent à 5mm

En Métropole, à la Station de Biologie de l’Université Montpellier II à Sète, sont mis au point des marqueurs génétiques permettant d’identifier les espèces et les populations d’anchois des genres Encrasicholina, et Stolephorus.
Au centre IRD de Nouméa, à partir de 2002, des analyses génétiques seront effectuées au laboratoire de biologie moléculaire.

Glossaire

Plasticité phénotypique : capacité des individus d'une même espèce à présenter des adaptations de leurs caractéristiquesmorphologiques, physiologiques, etc. en fonction de différentes conditions environnementales

Morphométrie : étude quantitative de la géométrie des formes

Otolithes : concrétion calcaire de l'oreille interne qui assure l'équilibre.

Larve : très jeune poisson qui possède des adaptations à la vie dans la colonne d'eau et dont la morphologie est souvent très différente de celle de l'adulte.

Juvénile : jeune poisson qui possède toutes les caractéristiques de l'adulte mais qui n'est pas encore mature.

Fécondité : nombre d'œufs produits par une femelle

Partenariat

· CSIRO, Cleveland, Australie : écologie des populations de petits pélagiques côtiers à Cleveland. Une seconde réunion avec nos partenaires du CSIRO a eu lieu à Nouméa en septembre 2002 grâce au financement de l'Ambassade de France à Canberra.

· Department of Biology, University of the South Pacific, Suva, Fidji : réunions de travail à Suva, financée pour moitié par l'Ambassade de France à Suva, afin de présenter notre projet. Les financements obtenus auprès de l'Ambassade de France à Suva et du " Fonds Pacifique " devraient permettre à un(e) étudiant(e) de l'University of South Pacific de venir se former en 2003 aux techniques utilisées dans notre laboratoire.

· URM 16 IFREMER / Laboratoire Génome Populations Interactions (UMR 5000 du CNRS), Station Méditerranéenne de l'Environnement Littoral à Sète : marquage moléculaire des anchois (genres Engraulis et Encrasicholina).

L'UR081 en Nouvelle-Calédonie accueillera dès 2002 des étudiants de l'Université Paris 6 (DEA d'Océanographie Biologique, option "Dynamique des Populations) et de l'Université Aix-Marseille (DEA Bioscience de l'Environnement, option Environnement Marin).

Au niveau régional, des réunions prévues en 2002 devraient formaliser les actions de formation prévues auprès d'étudiants de l'University of Queensland (Brisbane, Australie) et de l'University of the South Pacific (Suva, Fidji).

Deux étudiants de DEA et une étudiante de Maîtrise ont effectué un stage de recherche dans notre équipe en 2002.

· Janvier 2002 - septembre 2002 : Yanis BOUCHENAK-KHELLADI, Université Aix-Marseille II. Recherches pour l'obtention d'un DEA et soutenance d'un mémoire sur la structure génétique des populations lagunaires et océaniques de l'anchois Engraulis encrasicolus.

· Janvier 2002 - juin 2002 : Thierry HOAREAU, Université Paris 6. Recherches pour l'obtention d'un DEA et soutenance d'un mémoire sur les traits reproductifs de deux espèces d'anchois du lagon de Nouvelle-Calédonie.

· Juillet 2002 - août. 2002 : Delphine FRANKO, Université Aix-Marseille. Stage d'été à l'UR 081 : forme des otolithes de Encrasicholina devisi et E. heteroloba.

Bibliographie

CONAND F. 1988. - Biologie et écologie des poissons pélagiques du lagon de Nouvelle-Calédonie utilisables comme appât thonier. ORSTOM, Paris, 239 p.

LEIS J. M., CARSON-EWART B. M. 2001. The larvae of Indo-Pacific coastal fishes. An identification guide to marine fish larvae, Leiden : Brill, 850 p.

SARPÉDONTI V., PONTON D., CHONG V.-C. 2000. - Description and ontogeny of young Stolephorus baganensis and Thryssa kammalensis, two Engraulididae from Peninsular Malaysia. J Fish Biol., 56: 1460-1476.

 

Contact

Dominique PONTON

Philippe BORSA